99和39的最大公因数是3。根据分解质因数法，已知99=3×3×11，39=3×13，因此99和39的公因数除了1之外，只有3，所以99和39的最大公因数为3。最大公因数也叫做最大公约数，指的是两个或多个整数共有约数中最大的一个数。
99和39的最大公因数怎么求
99和39的最大公因数除了用分解质因数法，还可以用穷举法。已知99的因数有1、3、9、11、33、99，而39的因数有1、3、13、39。所以99和39的公因数是1、3，所以公因数中最大的数，即为最大公因数，所以99和39的最大公因数是3。
求公因数的办法
公因数也叫“公约数”。它是一个能同时整除若干整数的整数，如果一个整数同时是几个整数的因数，称这个整数为它们的“公因数。求公因数有多种方法，常见的有质因数分解法、短除法、辗转相除法、更相减损法。